El doctor Fàbregas va ser pioner en la creació del primer hospital de dia a Barcelona, i fins al final va dirigir el CPB, Centre de Psicoteràpia Barcelona–Serveis Salut Mental, una entitat que gestiona programes sanitaris i socials des dels serveis especialitzats de suport a l’atenció primària de salut fins als serveis residencials, passant pels d’internament i rehabilitació. No en va, aquest enfocament integral coincideix amb la creença de Josep Fàbregas de situar la relació amb els pacients com un instrument terapèutic de primer ordre i en estreta col·laboració amb els familiars dels pacients.
Autor de nombroses publicacions i llibres, principalment sobre psiquiatria comunitària, psicoteràpia grupal i organització de l’assistència psiquiàtrica, va mantenir una estreta col·laboració amb el COMB, sobretot en la creació de la Clínica Galatea, centre de tractament dels trastorns mentals, inclosos els addictius, especialitzat en l’assistència dels professionals sanitaris, fet que va possibilitar que el programa PAIMM gaudís d’un centre propi de gran qualitat.